おそらくセーブ時の処理のエラーだと思います。だいぶデータが混んできているのでしょう。
よく見ると会津若松周辺で数ヶ所このような現象が見られますね。
弊社線でも1960年ごろからたびたび発生して列車が詰まります(最新のセーブデータでも東郡山付近のポイントで起こっています)。
なお、「b」キーで付近の線路の閉塞エラーを取ってやると直るようです。
僕もはじめはEF-85さんにお願いして直していただきましたが、利益は減るものの自分のターンで直せばなんとかなる状態なので今はあまり気にしないようにしています。
ちなみに、今回MH35さんが指摘された場所のように分岐なしの線路の通常信号間の閉塞区間の場合は次の列車が通過する際にエラーが直るようです。